Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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