Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms