Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms