Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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