Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRZ1P23471 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRZ1P23471 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms