Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HRCP23327 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HRCP23327 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HRCP23327 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HRCP23327 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HRCP23327 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HRCP23327 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HRCP23327 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HRCP23327 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HRCP23327 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HRCP23327 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms