Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGFR3P22607 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR3P22607 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms