Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms