Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRHP20396 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRHP20396 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRHP20396 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRHP20396 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms