Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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