Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NME1P15531 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NME1P15531 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME1P15531 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms