Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM27P14373 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms