Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms