Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL2P13500 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms