Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms