Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms