Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI3P10071 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms