Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD1P0DJD0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms