Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYBBP04839 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms