Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PF4P02776 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PF4P02776 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PF4P02776 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PF4P02776 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PF4P02776 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PF4P02776 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PF4P02776 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PF4P02776 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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