Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms