Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms