Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPLO60437 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPLO60437 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPLO60437 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPLO60437 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms