Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPAG9O60271 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms