Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DENRO43583 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DENRO43583 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DENRO43583 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DENRO43583 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms