Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPO8O15397 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IPO8O15397 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IPO8O15397 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IPO8O15397 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IPO8O15397 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms