Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD1AO15047 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms