Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms