Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms