Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRP5LA4QPB2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRP5LA4QPB2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms