Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYVE1Q9Y5Y7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms