Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms