Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms