Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9Y3F1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9Y3F1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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