Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms