Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms