Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RABGEF1Q9UJ41 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RABGEF1Q9UJ41 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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