Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms