Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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