Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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