Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms