Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCC13Q9NSE7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCC13Q9NSE7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms