Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms