Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SEMA4BQ9NPR2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms