Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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