Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KIAA1549Q9HCM3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms