Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP29Q9HBJ7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms