Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms