Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCL11BQ9C0K0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms