Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP74Q9C0B2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP74Q9C0B2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms